|
|
مجله دانشگاه علوم پزشکی بابل، جلد ۱۷، شماره ۱۰، صفحات ۵۳-۵۹
|
|
|
| عنوان فارسی |
مقایسه هویت مولکولی مایکو پلاسماهومینیس ادرار بیماران مبتلا به عفونتهای با سایر جدایههای مشابه موجود در بانک ژن |
|
| چکیده فارسی مقاله |
سابقه و هدف: مایکوپلاسماها از عوامل مهم عفونتهای ادراری هستند. پژوهشهای زیادی بر پایه روشهای کشت و بیوشیمیائی جهت جداسازی این باکتری از دستگاه ادراری تناسلی انجام شده اما مطالعه مولکولی و فیلوژنتیک آنها اساس بررسیهای اپیدمیولوژیک خواهد بود. هدف از این تحقیق جداسازی و تعیین هویت مولکولی مایکوپلاسماهومینیس جداشده از ادرار بیماران مبتلا به عفونتهای ادراری شهر کرمان و مقایسه توالی آنها با سایر جدایههای موجود در بانک ژن می باشد. مواد و روشها: در این مطالعه مقطعی 5 میلی لیتر ادرار میانی 50 بیمار مبتلا به عفونت ادراری پس از تأیید پزشک متخصص توسط آزمایشات پاراکلینیکی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی قطعهای از ژن 16S rRNA مایکوپلاسما هومینیس به روش PCR تکثیر و پس از خالص سازی محصول PCR، جدایههای باکتری تعیین توالی شدند و سپس با استفاده از نرمافزار Bio Edit هم ردیفکردن توالیها و مقایسه جدایهها با یکدیگر و با سایر جدایههای موجود در بانک ژن انجام شد. یافته ها: 3 جدایه مایکوپلاسما هومینیس جدا گردید. همردیف کردن توالی ها و مقایسه آنها با توالیهای موجود در بانک ژن تفاوت معنی داری نداشت. مطالعات فیلوژنتیک انجام گرفته در این پژوهش و درخت فیلوژنتیک ترسیم شده نشان میدهد که یکی از جدایههای این پژوهش (جدایهH6 ) با سایر جدایه های ثبت شده در بانک ژن قرابت بالایی دارد و در یک دودمان قرار میگیرد. در حالیکه دو جدایه دیگر (11H و 15H) در یک دودمان جداگانه و کاملا مجزا از جدایه دیگر و سایر جدایههای ثبت شده در بانک ژن قرار گرفته و با تمام آنها قرابت ندارد. نتیجه گیری: مایکوپلاسماها از مهمترین عوامل عفونت ادراری هستند. در این مطالعه پس از انجام PCR و جداسازی باکتری، با مقایسه توالیها در بانک ژن تأیید گردید که هر سه جدایه بر اساس توالی ژن 16S rRNA، مایکوپلاسما هومینیس هستند. |
|
| کلیدواژه‌های فارسی مقاله |
|
|
| عنوان انگلیسی |
A Comparison between the Molecular Identity of Mycoplasma Hominis in Urine Samples of Patients with Urinary Tract Infections and Similar Strains Available in GenBank |
|
| چکیده انگلیسی مقاله |
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Mycoplasmal infections are one of the most important urinary infections. Various studies have applied culture studies and biochemistry to separate the bacteria from the urinary tract. However, it should be noted that molecular and phylogenetic analyses are based on epidemiologic evaluations. The purpose of this study was to determine the molecular identity of Mycoplasma hominis, separated from the urine samples of patients with urinary tract infections in Kerman, Iran and compare the sequences with other strains in GenBank. METHODS: In this cross-sectional study, 5 ml mid-stream urine samples of 50 patients with urinary tract infections were collected. After the specialists confirmed the diagnosis of urinary tract infections in patients via paraclinical tests, segments of 16S rRNA gene were amplified, using specific primers of Mycoplasma hominis via polymerase chain reaction (PCR) technique. After purifying the PCR product, the sequences of bacterial strains were determined. Then, the sequences were aligned and the strains were compared with each other and other strains available in GenBank, using BioEdit software. FINDINGS: Three Mycoplasma hominis strains were separated in this study. The alignment of sequences and comparison with strains available in GenBank did not indicate a significant difference between the strains. Based on phylogenetic analyses in this study and the phylogenetic tree, one of the strains (H6) was highly similar to the strains of GenBank and belonged to the same family. On the other hand, two strains (H11 and H15) were of a different lineage and were completely different from other strains in the present study and those recorded in GenBank. CONCLUSION: In this study, after applying the PCR technique and bacterial separation, the sequences were compared with those in GenBank. All three strains were Mycoplasma hominis, based on 16S rRNA gene sequence. |
|
| کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله |
|
|
| نویسندگان مقاله |
حکیمه افتخاری | h eftekhari
بابک خیرخواه | b kheirkhah
باقر امیر حیدری | b amirheydari
|
|
| نشانی اینترنتی |
http://www.jbums.org/browse.php?a_code=A-10-1449-1&slc_lang=fa&sid=fa |
| فایل مقاله |
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است |
| کد مقاله (doi) |
|
| زبان مقاله منتشر شده |
fa |
| موضوعات مقاله منتشر شده |
میکروبیولوژی |
| نوع مقاله منتشر شده |
توصیفی |
|
|
|
برگشت به:
صفحه اول پایگاه |
نسخه مرتبط |
نشریه مرتبط |
فهرست نشریات
|